La Universidad del Rosario, en colaboración con el Instituto Nacional de Salud (INS) y el Ichan School of Medicine at Mount Sinai de Estados Unidos, realizaron un estudio en el que se descubrió que según las mutaciones en el genoma del virus el primer evento de introducción al país del Covid-19 pudo ser el 17 de febrero, siendo Francia el origen más probable del virus y no el 6 de marzo como se pensaba inicialmente.
Juan David Ramírez, director del Laboratorio de Microbiología de la Universidad del Rosario explicó que “la secuenciación del genoma del virus permite hacer una vigilancia de alta resolución de esta epidemia. Con estos datos se puede determinar el origen y dispersión de este, al poder establecer los distintos tipos de virus que circulan en diferentes regiones geográficas”.
Estas secuencias se definen como linajes, es decir, mutaciones del virus que se acumulan en el tiempo, pues el virus descrito inicialmente en Wuhan, China, es diferente al de ahora.
Así mismo, los análisis de las mutaciones del virus permiten establecer la escala temporal en la cual estos linajes se introdujeron en una región geográfica en específico. A la fecha se han reportado al menos 81 linajes del virus alrededor del mundo.
Hasta el pasado 5 de abril se informaron dos secuencias del genoma del nuevo coronavirus en Colombia reportadas por el INS. La primera fue de una muestra recolectada en Medellín de un paciente de 28 años, que se agrupó con los miembros del linaje B, que incluye principalmente secuencias de origen chino. El segundo, recogido el 6 de marzo de un paciente en Bogotá, de 10 a 20 años, perteneciente al linaje A2a, correspondiente a cepas de origen europeo.
Ramírez resaltó además que la disponibilidad de estos dos genomas ha proporcionado información importante sobre la existencia de diferentes introducciones del Covid-19 en Colombia. No obstante, se requerirán más para conocer los linajes circulantes en el país.
En total, las instituciones han encontrado cerca de 88 genomas de SARS-CoV2 de 4 regiones biogeográficas (Andina, Caribe, Pacífica y Orinoquía) de 16 departamentos.
En Colombia, los resultados mostraron la circulación de 11 linajes distintos en el país y al menos seis posibles introducciones durante la dispersión de SARS-CoV-2 en el país, explicó Ramírez.
«El primer evento se asoció con el linaje A2 cuya introducción ocurrió el 17 de febrero, casi un mes antes de reportarse el primer caso en Colombia. Este se detectó en Caldas, siendo Francia el origen más probable. El segundo evento identificado correspondió al linaje A2a, que se detectó en el departamento de Antioquia, siendo México la ubicación ancestral más probable. El tercer evento involucró dos muestras estrechamente relacionadas que pertenecen al linaje B que se detectaron en Antioquia. La ubicación ancestral más probable en este caso fue Estados Unidos», expresó Ramírez.
Los otros eventos se presentaron en Antioquia, Nariño, Tolima y Valle del Cauca. Estos eran provenientes de Polonia, Vietnam y España.
“Este es el primer análisis sólido de los genomas del SARS-CoV2 en Colombia y América Latina y proporciona información importante para la toma de decisiones en términos de vigilancia y planificación de medidas efectivas contra la propagación de la pandemia”, afirmó Ramírez.
Finalmente, Ramírez enfatizó que «los hallazgos muestran la múltiple y temprana introducción del virus en el país y respalda la relevancia de la vigilancia genómica y la necesidad fundamental de establecer esfuerzos coordinados para generar datos genómicos en América del Sur que permitan realizar análisis integradores para descubrir la dinámica del Covid-19 a nivel continental”.
El primer caso de coronavirus reportado oficialmente en Colombia fue el de una paciente de 19 años, proveniente de Milán, a comienzos de marzo.
